Lietuvoje cukraus pramonė pradėjo kurtis 1930 m., kai Lietuvos vyriausybės pakviesta Čekoslovakijos firma „Škoda“ kartu su lietuvių įmone „Markūnas ir Brat” pietinėje Marijampolės miesto dalyje, prie geležinkelio, pradėjo statyti cukraus fabriką. „Lietuvos cukrus" duris atvėrė kitų metų spalio 15 d. ir pradėjo perdirbinėti cukrinius runkelius. Pirmuoju fabriko direktoriumi tapo Juozas Jankauskas, kuris įmonei vadovavo iki savo mirties 1937 m.
1931 m. pradėjęs veikti pirmasis šalyje cukraus fabrikas turėjo labai didelės įtakos Sūduvos krašto vystymuisi ne tik ekonominiam, bet ir socialiniam, kultūriniam, sportiniam. Cukraus fabrikas tuo metu buvo stambiausia šios šakos įmonė visoje šalyje. Jame veikė daug sporto, socialinių, kultūrą puoselėjančių būrelių. Net aplinkiniai miestai ir miesteliai žinojo cukraus fabriko orkestrą.
1935 m. fabriko sandėlyje kilo gaisras, kuris sunaikino 3 tūkst. tonų cukraus. Tačiau kur kas didesnių nuostolių fabrikas patyrė Antrojo pasaulinio karo metais: buvo sugriautas, o atstatymo darbai vyko iki 1947 m., 1962 m. prasidėjo nauja fabriko rekonstrukcija. Perstatyti runkelių padavimų, difuzijos, kalkinės, kompresorinės, katilinės, transporto skyriai. Įvykdžius šiuos pakeitimus P. Armino g. likviduotas didžiausias purvo šaltinis. Rekonstrukcija vyko iki 1990 metų.
Sunkų periodą fabrikas pergyveno 1996–1999 m. Šiuo laikotarpiu vyko įmonės privatizacija: daug kartų keitėsi įmonės valdymas, nevyko modernizacija. Tačiau lemtingas posūkis fabriko gyvenime įvyko 1999 metų rudenį, kai įmonių grupė ,,Arvi” pradėjo finansuoti fabriką. Naujieji investuotojai nuo pirmųjų dienų daug dėmesio ir lėšų skyrė fabriko modernizavimui ir atnaujinimui. Rezultatų ilgai laukti nereikėjo, kadangi 1999 m. pasiekti geriausi gamybos rodikliai visoje fabriko istorijoje. Nuo 2017 m. Marijampolės cukraus fabrikas pavadintas UAB „Lietuvos cukrus”
2011-10-15 minint fabriko 80 m. jubiliejų, jo teritorijoje buvo atidengtas paminklas cukriniam runkeliui – Sūduvos krašto klestėjimo simboliui. Kūrinio autorius T. Pavilionis. 2016-09-08 cukraus fabrikas paminėjo 85 metų jubiliejų.